IBM comercializará lectura de genoma

IBM se asoció con Roche, un fabricante de dispositivos médicos, para construir un dispositivo de bajo costo que pueda leer genomas humanos, anunció la compañía el jueves.

A pesar de que la tecnología aún puede estar a una década o más de su comercialización, una vez terminada, debería brindarle a cada médico una forma rápida y de bajo costo. de examinar la composición genómica de un paciente, dijo Ajay Royyuru, gerente senior de biología computacional en IBM Research.

"El costo de la secuenciación del genoma ha bajado, y la velocidad ha comenzado a mejorar, pero todavía hay problemas con la velocidad, la escala, el rendimiento, así como el costo ", dijo Royyuru.

El proyecto utilizará el" Transistor de ADN "de IBM. Estos transistores contienen nanoporos, o poros muy pequeños, a través de cada uno de los cuales se puede procesar una cadena de ácido desoxirribonucleico (ADN). El nanoporo identifica cada base del ADN mediante el uso de un campo eléctrico.

Debido a que el nanoporo está hecho en parte de silicio, debe poder producirse en masa con las mismas técnicas de litografía utilizadas para fabricar microprocesadores, manteniendo así la producción Cuesta abajo, dijo Royyuru.

Mientras otros investigadores también han explorado el uso de nanoporos, estos diseños no pueden leer con precisión el ADN, porque el ADN viaja demasiado rápido a través del poro.

"Es como chuparse los espaguetis. comienza a moverse a través del nanoporo, va muy rápido. Hemos visto 48,000 unidades de ADN pasar en 10 o 20 milisegundos. A esa velocidad, tienes muy pocas posibilidades de leer correctamente ", dijo Royyuru.

Para reducir la velocidad velocidad del ADN, IBM ha diseñado un control eléctrico en el nanopore para enganchar el flujo a la velocidad deseada. "Podemos controlar eléctricamente el movimiento del ADN a través del poro. Podemos avanzar unidad por unidad", dijo.

Aunque las tecnologías de secuenciación de ADN han existido desde principios de la década de 1970, no se descodificó todo el genoma humano en su totalidad hasta 2001, debido al autómata necesario para decodificar la gran cantidad de pares de bases que deben leerse. El ADN de cada persona contiene alrededor de 3 mil millones de pares de bases de nucleótidos.

Aunque la tecnología de secuenciación de ADN ha mejorado desde entonces, todavía cuesta unos pocos cientos de miles de dólares leer un genoma humano completo, dijo Royyuru. Una vez listo, este dispositivo debería poder hacer el trabajo por entre US $ 100 y $ 1,000 por lectura, Royyuru estimó.

Royyuru se negó a ofrecer un momento en que la máquina esté disponible comercialmente, citando los muchos pasos necesarios para llevar cualquier tecnología radicalmente nueva para la producción. Estimó que tomaría entre cinco y diez años terminar la investigación por sí solo.

La filial de secuenciación de Roche, 454 Life Sciences, finalmente comercializará los productos resultantes de esta colaboración. IBM aportará a la asociación su experiencia en la construcción de electrónica y gestión de datos, mientras que Roche aplicará sus conocimientos en diagnóstico médico y secuenciación del genoma, dijo Royyuru.

Leer el código genético de un individuo podría tener múltiples beneficios médicos, explicó Royyuru. En particular, permitirá a los médicos "personalizar el suministro de atención médica", dijo. Por ejemplo, muchos medicamentos funcionarán en algunas personas, pero no en todas. Tener el ADN de una persona a mano ayudará al médico a recetar el medicamento apropiado. Además, leer el genoma puede revelar la susceptibilidad a ciertas enfermedades.

Quizás otro uso temprano podría ser determinar cuánto tiempo vivirán las personas. El jueves, investigadores de la Universidad de Boston anunciaron que encontraron lo que parecen ser signos genéticos de longevidad.

Joab Jackson cubre el software de Enterpise y noticias de última hora sobre tecnología general para The IDG News Service. Sigue a Joab en Twitter en @Joab_Jackson. La dirección de correo electrónico de Joab es [email protected]